随着农业科技的不断创新发展，农林部门思想政治工作也必须适应变化了的新情况，大胆进行探索和创新，增强思想政治工作的针对性，突出实效性，争取主动性，加快科技创新步伐，为现代农业和“三农”经济发展作出应有贡献。
一、充分认识思想政治工作创新的重要意义，增强主动性。
新的形势下，切实加强和改进思想政治工作，实现思想政治工作创新，是关系到农林部门科技创新的重大问题。
一是思想政治工作创新为科技创新提供精神动力。思想政治工作的对象是人，而人是有思想的，思想是行为的先导和动力，有正确思想才有正确的行为，有积极的思想才有积极的行为。因此，科学技术的发展和创新必须依靠思想政治工作提供精神动力。思想政治工作通过做人的思想工作，可以极大地激发人们的积极性、主动性和创造性，为科技创新提供巨大的精神动力。
二是思想政治工作创新为科技创新提供思想保证。思想政治工作是用正确的理论武装人、先进的文化教育人，传授给人们科学的认知方法，提高认识世界和改造世界的能力，保证正确的政治方向。科技创新离不开科学的理性思维，需要先进的哲学思想提供正确的指导，只有掌握了正确的理性思维工具，才可以更好地揭示事物的发展规律，才能不断开辟认识真理的途径。
因此，思想政治工作必须根据科技创新的实际，主动适应科技创新的新形势，主动把科技创新的内容融入到思想政治工作之中，以此促进和推动科技创新深入发展。
二、创新思想政治工作的内容和方式方法，增强实效性。
当前，随着社会主义市场经济的进一步深化发展，党员的思想观念发生了重大变化，作为科技人员集聚的农林系统的党员，思想更呈现出复杂性、多样化。面对诸多新问题、新情况，思想政治工作必须在内容、方式方法上进行创新，必须改变以往传统的空洞说教和死板灌输的刻板模式，善于寻找载体，通过不同载体和不同形式，使工作变无形为有形，变抽象为具体，变空洞为生动，增强工作的感染力和说服力。
一是要围绕中心，服务大局。农林部门的中心任务就是要推进科技创新，提升农业科技在社会经济发展中的科技支撑作用。思想政治工作作为一项“软任务”，尤其要善于找准与中心任务的结合点，注重改进教育活动的内容和方式，做到围绕科技创新抓思想政治工作，为科技创新提供坚实有力的思想保证和政治保证。
二是创新思想政治工作的内容。要充分利用党建理论最新成果，不断充实思想政治工作的教育内容，提高农技人员的思想道德素质和科学文化素质。可以结合每年一度的农技人员继续教育和农民培训等载体，着重抓好农技人员的“信仰、信念、信心”问题，加强共产主义远大理想、中国特色社会主义理论体系和社会主义核心价值观的宣传教育，自觉用科学发展观武装农技人员头脑。围绕和谐社会、社会主义新农村、科学发展观、区域经济等内容，开展形式多样的时代主题教育活动。
三、创新机制体制，构建思想政治工作长效机制。
思想政治工作机制体制创新是新形势下科技创新的需要，也是增强思想政治工作生机和活力的迫切要求，思想政治工作机制创新包括责任机制、考核评价机制和保障机制。
一是要建立健全责任机制。要进一步突出党委在思想政治工作中的领导地位，明确领导职责，进一步构建思想政治工作网络化工作机制，确保农林系统思想政治工作健康、有序、稳步地发展。
二是要建立健全考核评价机制。要紧密结合农业科技创新和思想政治工作实际，结合目标管理责任状和农技人员业务考核体系，建立和完善多形式、多层次、多方面的综合性考核评价体系，逐步建立和完善有效的激励奖惩机制。
三是建立健全保障机制。要建立规范的、有效的保证制度，完善思想政治工作的投入机制，加强思想政治工作部门的软硬件建设，实现思想政治工作手段的现代化和信息化。
总之，农林部门要根据现代农业发展的新形势需要，立足科技创新新情况，深入研究思想政治工作的特点和规律，不断探索有效途径，主动适应科技创新，为提高农林部门综合竞争力、推进科技创新、提升科技支撑作用提供坚实的思想保证、精神动力和智力支持。